130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01136 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01136  Tfp pilus assembly protein PilE  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  75 
 
 		 163 aa  200  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  43.85 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0671  hypothetical protein  40.31 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.228298  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  34.81 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  30.88 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  31.01 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  30.53 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  33.58 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  29.32 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  28.57 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  29.25 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  28.79 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  32.64 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  30.6 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  30.47 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  28.68 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  32.06 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  32.06 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  45.45 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  52.08 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  30.83 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  35.06 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  47.06 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  28.26 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  35.06 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  29.71 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  35.14 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  28.24 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  27.91 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  45.1 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  35.14 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  30.37 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  29.1 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  29.1 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  28.91 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  28.91 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  29.7 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  42.59 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2024  hypothetical protein  36.96 
 
 		 173 aa  47  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.833436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  42.59 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  27.54 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.19 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  39.58 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  32.33 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  29.32 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.71 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  43.14 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  39.58 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  28.36 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  29.32 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  28.57 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  29.32 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  46.67 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  40.38 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  33.78 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  45 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  35.59 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  35.59 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  42.59 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0932  type IV pilus biogenesis protein PilE  30.23 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  43.18 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  35.42 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  26.27 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  25.2 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  47.73 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  46.81 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  25.2 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  45.45 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  45 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  41.18 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  43.14 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  39.58 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  42.86 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  40 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  40.38 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  48.84 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  46.15 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  55.88 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  43.9 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  55.26 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03022  general secretion pathway protein H  31.25 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  39.58 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  32.65 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  48.48 
 
 		 150 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  41.67 
 
 		 160 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.14 
 
 		 174 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.14 
 
 		 163 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.35 
 
 		 161 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  45 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  52.94 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  35.85 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  38 
 
 		 180 aa  41.2  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  40.35 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  25.74 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.78 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  25.98 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>