More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17770 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  261  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  49.23 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  49.23 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1319  secretory protein  41.67 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0113151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  46.03 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  38.74 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  40.62 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  39.71 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  52.46 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  41.27 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  52.54 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  55.77 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  38.26 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  38.24 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  38.24 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  54.39 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  45.57 
 
 		 186 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  45.57 
 
 		 186 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  42.59 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  39.29 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  51.79 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  31.06 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  40.68 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  53.45 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  42.65 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  42.59 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  50.91 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  34.02 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  54.35 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  40.35 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1318  secretory protein  52.94 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.011576 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  40.98 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  53.45 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  40.98 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.94 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  40.98 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  46.94 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  44.83 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  40.98 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  46.3 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  69.44 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  58.97 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  51.92 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  34.75 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1011  hypothetical protein  37.72 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  6.60577e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  36.84 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  35.63 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  51.06 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  48.94 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  33.87 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  47.46 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  50 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  44.07 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  46.3 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  59.38 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  56.52 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.52 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  38.6 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  39.74 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  35.87 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  44.44 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  37.93 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  47.37 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  40.66 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.52 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  43.55 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  45.45 
 
 		 171 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  36.7 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  34.86 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  38.37 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15291  Tfp pilus assembly protein PilE  38.36 
 
 		 194 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.420018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1170  xcmT3  36.27 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  37.93 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.79 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  57.45 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  34.62 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.16 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  35.48 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.16 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  37.29 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.35 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  58.97 
 
 		 160 aa  50.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  53.19 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  40.35 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3024  secretory protein  46.97 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>