More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0651 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  98.45 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  89.92 
 
 		 129 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  82.95 
 
 		 129 aa  213  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  41.09 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  40.31 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  41.79 
 
 		 148 aa  87.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  38.17 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  36.43 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  34.03 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  35.34 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  34.19 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  35.71 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  37.98 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  36.88 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.71 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  28.36 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  28.36 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  31.91 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  32.19 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  37.41 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  30.6 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  29.2 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  31.54 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  31.54 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  32.12 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  32.12 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  28.57 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  30.46 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  31.85 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  34.78 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  34.13 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  27.33 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  34.62 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  35.04 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  34.62 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0957  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.04 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  30.83 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  33.9 
 
 		 164 aa  57  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4842  hypothetical protein  32.08 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0454526  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  26.47 
 
 		 172 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.35 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  34.09 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.27 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  48.08 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  30.71 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  31.82 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  31.39 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  35.37 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  29.58 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  58.54 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.04 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0193  pilus assembly protein PilE  34.06 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.29 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  36.05 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  41.67 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  29.93 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.29 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  36.84 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  29.77 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  36.84 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  25.36 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  30.71 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  56.1 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0853  methylation site containing protein  32.28 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0830  methylation site containing protein  32.28 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0865  methylation site containing protein  32.28 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0854  type IV pilin, putative  35.16 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.89 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1287  type 4 fimbrial biogenesis signal peptide protein  32.17 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  60.98 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.39 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  49.09 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.37 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  49.12 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  31.34 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  27.74 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  27.74 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  53.19 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  41.1 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.35 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.04 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  49.02 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.54 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0710  methylation site containing protein  34.65 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  47.17 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3424  methylation site containing protein  34.65 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.16 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  28.03 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3312  methylation site containing protein  34.65 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  56.1 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  52 
 
 		 196 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  28.47 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.62 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  29.58 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  41.67 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  44.26 
 
 		 179 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.04 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  56.1 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>