More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0788 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  100 
 
 		 163 aa  329  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  42.58 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  43.51 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  40 
 
 		 135 aa  95.5  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  37.91 
 
 		 133 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  38.16 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  38.16 
 
 		 144 aa  94.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  37.11 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  38.56 
 
 		 133 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  40.54 
 
 		 144 aa  91.7  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  37.31 
 
 		 122 aa  84.3  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  34.93 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  31.68 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  38.82 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  34.93 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  43.84 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  36.25 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  36.42 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  36.42 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  35.53 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  31.1 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  38.28 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  39.31 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  36.81 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.22 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  34.72 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  34.51 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  34.03 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  35.86 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  33.56 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  35.26 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3224  type IV pilin  38.51 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  31.29 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  34.01 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.11 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  34.93 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  36.77 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  35.22 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0830  methylation site containing protein  38.19 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0865  methylation site containing protein  38.19 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0853  methylation site containing protein  38.19 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0854  type IV pilin, putative  38.62 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  29.86 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  30.82 
 
 		 141 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  29.8 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  29.8 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2443  hypothetical protein  34.25 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0710  methylation site containing protein  39.16 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3424  methylation site containing protein  37.24 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  32.45 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  32.24 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3312  methylation site containing protein  39.16 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  30.61 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1287  type 4 fimbrial biogenesis signal peptide protein  32.67 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  51.79 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  30.56 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  51.79 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  33.08 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0020  PilE protein  32.95 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  32.64 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  30.56 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  29.08 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  41.33 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  32.64 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  31.03 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  49.06 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  32.62 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  41.67 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4842  hypothetical protein  34.44 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0454526  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  28.67 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40.28 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  32.8 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  32.8 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  50.98 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.84 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.55 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.62 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  59.46 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.18 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0193  pilus assembly protein PilE  32.45 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0957  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.97 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0778  putative Tfp pilus assembly protein PilE  39.39 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32654  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  28 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.87 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5269  general secretory pathway protein  38.81 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  41.18 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  36.56 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  36.56 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  50 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.18 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  37.66 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  39.34 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  63.89 
 
 		 196 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  38.1 
 
 		 141 aa  52  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  61.11 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  45.61 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2686  pilus assembly protein PilE  28.93 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>