More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1161 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
157 aa  321  2e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.99 
 
 
163 aa  183  8e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.45 
 
 
167 aa  113  8.999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.35 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.03 
 
 
175 aa  108  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.33 
 
 
161 aa  106  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  71.62 
 
 
147 aa  104  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.87 
 
 
193 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.06 
 
 
159 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.82 
 
 
169 aa  100  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.06 
 
 
155 aa  100  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.44 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  58.76 
 
 
163 aa  99  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.93 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.42 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60 
 
 
165 aa  99  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  68.49 
 
 
169 aa  98.2  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.56 
 
 
166 aa  97.8  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  67.5 
 
 
79 aa  97.8  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.19 
 
 
158 aa  97.1  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.03 
 
 
171 aa  96.3  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  66.67 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53 
 
 
165 aa  95.5  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.11 
 
 
167 aa  95.5  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.62 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  38.79 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.49 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  65.75 
 
 
174 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.04 
 
 
167 aa  91.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  62.86 
 
 
172 aa  89.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.33 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  43.51 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.88 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.94 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  60.76 
 
 
168 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  62.16 
 
 
155 aa  87.8  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  50.54 
 
 
171 aa  87.4  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.89 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.32 
 
 
175 aa  85.5  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  39.13 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.46 
 
 
171 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  57.32 
 
 
172 aa  84.7  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  48.28 
 
 
182 aa  84.3  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  61.64 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  64 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.89 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.8 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.9 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  42.24 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  50 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  39.62 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  49.46 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  49.49 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  53.42 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  36.94 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  86.67 
 
 
48 aa  74.7  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  55.56 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.7 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  46.58 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  45.83 
 
 
634 aa  66.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  45.83 
 
 
527 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  45.26 
 
 
567 aa  64.7  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  29.75 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.46 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.27 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  51.32 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  51.32 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  44.62 
 
 
221 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  43.01 
 
 
548 aa  60.8  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  48.61 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.1 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  48.61 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  40.66 
 
 
176 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  41.67 
 
 
177 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  41.67 
 
 
177 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  46.67 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  43.33 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  48.21 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  28.99 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  38.61 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  60.47 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  29.52 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  35.29 
 
 
208 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  43.82 
 
 
187 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  35.21 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  37.5 
 
 
178 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  37.33 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  36 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  36 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  45 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  47.37 
 
 
196 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  38.46 
 
 
131 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  38.46 
 
 
131 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  38.57 
 
 
155 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  58.14 
 
 
169 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  44.07 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  29.03 
 
 
138 aa  53.9  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  41.86 
 
 
148 aa  53.9  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.86 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>