More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3384 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  100 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  84.05 
 
 		 163 aa  273  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  83.44 
 
 		 159 aa  265  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  87.77 
 
 		 156 aa  264  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  89.55 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  79.71 
 
 		 154 aa  235  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  78.26 
 
 		 158 aa  234  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  74.48 
 
 		 150 aa  233  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  73.79 
 
 		 150 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  73.79 
 
 		 150 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  73.79 
 
 		 150 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  77.54 
 
 		 154 aa  231  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  73.1 
 
 		 150 aa  230  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  73.1 
 
 		 150 aa  230  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  73.1 
 
 		 150 aa  230  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  75.54 
 
 		 155 aa  229  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  71.79 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  75.37 
 
 		 150 aa  223  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  75.37 
 
 		 150 aa  223  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  75.37 
 
 		 150 aa  223  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  75.37 
 
 		 150 aa  223  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  75.37 
 
 		 150 aa  223  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  75.37 
 
 		 150 aa  223  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  75.37 
 
 		 150 aa  223  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  75.37 
 
 		 150 aa  223  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  65.38 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  64.74 
 
 		 159 aa  210  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  77.21 
 
 		 167 aa  210  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  66.43 
 
 		 149 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  64.94 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  64.05 
 
 		 165 aa  204  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  68.84 
 
 		 150 aa  202  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  65.96 
 
 		 146 aa  201  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  68.31 
 
 		 149 aa  200  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  66.67 
 
 		 144 aa  199  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  68.66 
 
 		 162 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  67.61 
 
 		 149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  65.49 
 
 		 147 aa  198  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  63.57 
 
 		 142 aa  196  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  62.68 
 
 		 148 aa  196  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  64.29 
 
 		 144 aa  195  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  62.41 
 
 		 158 aa  193  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  65.94 
 
 		 140 aa  193  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  65.94 
 
 		 140 aa  193  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  66.43 
 
 		 139 aa  189  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  60.78 
 
 		 166 aa  188  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3521  general secretion pathway protein G  69.29 
 
 		 125 aa  187  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0236971  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  62.76 
 
 		 152 aa  186  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  60.87 
 
 		 141 aa  183  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  61.59 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  55.63 
 
 		 144 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  55.63 
 
 		 150 aa  173  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  55.63 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  60.43 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  63.24 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  54.93 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  55.24 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  54.93 
 
 		 144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  57.14 
 
 		 146 aa  170  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  59.7 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  59.7 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  57.14 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  57.14 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  57.14 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  57.14 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  57.14 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  54.68 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  60.29 
 
 		 147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  56.52 
 
 		 144 aa  163  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  57.89 
 
 		 151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  58.7 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  53.96 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  53.52 
 
 		 153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2215  general secretion pathway protein G  60.42 
 
 		 145 aa  160  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  54.35 
 
 		 144 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  57.25 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  50.97 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  55.4 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  51.09 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  53.62 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  53.62 
 
 		 144 aa  155  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  53.62 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  53.62 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  53.62 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  54.74 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  53.62 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  53.62 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  53.62 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  53.96 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  52.9 
 
 		 144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  53.96 
 
 		 144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  47.89 
 
 		 146 aa  153  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  52.9 
 
 		 145 aa  153  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  52.9 
 
 		 145 aa  153  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  52.9 
 
 		 145 aa  153  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  52.9 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  57.86 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  51.8 
 
 		 144 aa  150  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  51.41 
 
 		 144 aa  150  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  52.99 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>