More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3419 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  100 
 
 		 150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  81.12 
 
 		 165 aa  249  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  83.82 
 
 		 159 aa  244  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  83.82 
 
 		 159 aa  244  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  80.56 
 
 		 146 aa  244  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  82.14 
 
 		 158 aa  241  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  84.09 
 
 		 162 aa  239  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  81.82 
 
 		 158 aa  235  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  77.62 
 
 		 147 aa  233  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3521  general secretion pathway protein G  84 
 
 		 125 aa  224  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0236971  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  82.22 
 
 		 139 aa  216  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  68.79 
 
 		 163 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  71.32 
 
 		 156 aa  209  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  68.84 
 
 		 154 aa  202  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  67.15 
 
 		 159 aa  200  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  66.19 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  66.67 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  67.39 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  65.71 
 
 		 150 aa  197  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  64.83 
 
 		 149 aa  197  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  64.83 
 
 		 149 aa  196  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  65.22 
 
 		 158 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  65 
 
 		 150 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  65 
 
 		 150 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  65 
 
 		 150 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  63.57 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  63.57 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  63.57 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  65 
 
 		 152 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  65.41 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  64.18 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  64.18 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  64.18 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  64.18 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  64.18 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  64.18 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  64.18 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  64.18 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  61.59 
 
 		 155 aa  183  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  57.64 
 
 		 149 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  60 
 
 		 144 aa  180  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  66.17 
 
 		 167 aa  175  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  55.41 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  58.87 
 
 		 144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  53.57 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  54.68 
 
 		 144 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  57.66 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  56.93 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  58.09 
 
 		 166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  55.63 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  52.94 
 
 		 140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  52.94 
 
 		 140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  54.48 
 
 		 147 aa  159  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  55.64 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  54.17 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  54.81 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  53.57 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  54.07 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  55.22 
 
 		 147 aa  151  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  50.68 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  57.25 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  50.7 
 
 		 144 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2215  general secretion pathway protein G  63.16 
 
 		 145 aa  150  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  49.66 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  49.66 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  49.66 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  49.66 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  49.66 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  49.66 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  51.02 
 
 		 153 aa  146  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  53.73 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  50.74 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  50.36 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  54.17 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  52.17 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  51.82 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0326  general secretion pathway protein G  54.86 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  47.89 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  51.49 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  49.25 
 
 		 209 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3367  general secretion pathway protein G  53.47 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0663921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  46.48 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  48.32 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  50.75 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  47.14 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  46.43 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  47.95 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  47.14 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0680  general secretion pathway protein G  52.41 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  47.14 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  48.18 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  45 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  50.75 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  52.17 
 
 		 163 aa  129  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  46.72 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  50.75 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  46.72 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  46.72 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  46.72 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  48.91 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>