More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1032 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  100 
 
 
153 aa  313  8e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  58.57 
 
 
147 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  52.94 
 
 
166 aa  164  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  55.15 
 
 
150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  52.9 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  53.68 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  58.09 
 
 
156 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  51.32 
 
 
156 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  54.55 
 
 
163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  53.52 
 
 
154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  55.15 
 
 
150 aa  160  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  46.84 
 
 
158 aa  160  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  52.82 
 
 
147 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  52.94 
 
 
154 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  50.31 
 
 
159 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  54.41 
 
 
150 aa  158  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  54.41 
 
 
150 aa  158  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  54.41 
 
 
150 aa  158  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  54.41 
 
 
150 aa  158  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  54.41 
 
 
150 aa  158  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  51.06 
 
 
155 aa  158  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  54.41 
 
 
150 aa  158  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  54.41 
 
 
150 aa  158  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  54.05 
 
 
149 aa  158  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  54.41 
 
 
150 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  54.41 
 
 
150 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  54.41 
 
 
150 aa  158  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  53.68 
 
 
150 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  53.68 
 
 
150 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  53.68 
 
 
150 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  53.68 
 
 
156 aa  153  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  55.03 
 
 
144 aa  153  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  50.7 
 
 
159 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  50.7 
 
 
159 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  52 
 
 
148 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  57.14 
 
 
147 aa  150  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  47.95 
 
 
149 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  52.86 
 
 
140 aa  149  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  52.86 
 
 
140 aa  149  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  54.35 
 
 
144 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  52.38 
 
 
158 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  53.1 
 
 
142 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  50 
 
 
149 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0326  general secretion pathway protein G  55.8 
 
 
147 aa  147  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  50.66 
 
 
150 aa  147  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  49.66 
 
 
146 aa  147  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0680  general secretion pathway protein G  54.11 
 
 
147 aa  147  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  51.02 
 
 
150 aa  146  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  49.65 
 
 
147 aa  146  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3367  general secretion pathway protein G  56.52 
 
 
147 aa  146  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0663921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  50 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  52.17 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  48.25 
 
 
146 aa  144  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  51.47 
 
 
162 aa  143  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  46.58 
 
 
147 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  45.7 
 
 
151 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  45.7 
 
 
151 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  45.7 
 
 
151 aa  141  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  45.7 
 
 
151 aa  141  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  48.59 
 
 
158 aa  141  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  47.1 
 
 
151 aa  141  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  45.7 
 
 
151 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  50.74 
 
 
146 aa  140  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  54.01 
 
 
167 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  48 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  50 
 
 
165 aa  137  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  51.88 
 
 
161 aa  137  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  48.59 
 
 
139 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  49.63 
 
 
143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  46.58 
 
 
144 aa  134  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  43.06 
 
 
144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  43.06 
 
 
151 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  43.06 
 
 
144 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  46.58 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  48.89 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  47.83 
 
 
144 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  47.83 
 
 
144 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  47.83 
 
 
144 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  47.83 
 
 
144 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  48.89 
 
 
159 aa  130  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  47.83 
 
 
144 aa  130  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 
144 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  49.66 
 
 
150 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  47.1 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  45.21 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  51.05 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  45.21 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  47.1 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  47.1 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  47.1 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3521  general secretion pathway protein G  48.84 
 
 
125 aa  128  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0236971  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  44.52 
 
 
144 aa  128  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  46.67 
 
 
158 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  49.25 
 
 
156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  48.94 
 
 
145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  50.34 
 
 
146 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  45.89 
 
 
172 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  41.25 
 
 
157 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  47.52 
 
 
145 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  42.76 
 
 
144 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>