More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1090 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  100 
 
 
144 aa  294  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  98.61 
 
 
151 aa  293  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  97.92 
 
 
144 aa  289  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  95.14 
 
 
144 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  55.56 
 
 
149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  56.52 
 
 
149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  57.75 
 
 
146 aa  181  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  56.94 
 
 
144 aa  180  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  58.39 
 
 
157 aa  179  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  53.47 
 
 
146 aa  177  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  53.47 
 
 
147 aa  177  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  57.45 
 
 
144 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  57.97 
 
 
150 aa  175  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  58.82 
 
 
153 aa  175  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  55.07 
 
 
155 aa  174  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  57.78 
 
 
151 aa  173  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  57.78 
 
 
151 aa  173  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  57.78 
 
 
151 aa  173  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  57.78 
 
 
151 aa  173  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  57.78 
 
 
151 aa  173  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  57.78 
 
 
151 aa  173  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  55.63 
 
 
154 aa  172  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  53.52 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  55.71 
 
 
144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  55.07 
 
 
156 aa  170  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  55.4 
 
 
158 aa  170  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  55.4 
 
 
154 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  54.68 
 
 
154 aa  169  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  55.56 
 
 
163 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  54.17 
 
 
144 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  55 
 
 
144 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  55.97 
 
 
159 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  52.45 
 
 
150 aa  168  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  57.14 
 
 
156 aa  168  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  54.29 
 
 
144 aa  168  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  53.57 
 
 
144 aa  167  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  53.96 
 
 
142 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  53.96 
 
 
144 aa  165  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  51.75 
 
 
150 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  57.25 
 
 
156 aa  165  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  51.75 
 
 
150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  51.75 
 
 
150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  51.05 
 
 
150 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  51.05 
 
 
150 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  51.05 
 
 
150 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  53.47 
 
 
144 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  53.47 
 
 
144 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  53.47 
 
 
144 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  53.47 
 
 
144 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  53.24 
 
 
148 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  52.94 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  52.08 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  52.94 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  53.68 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  52.94 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  54.86 
 
 
143 aa  160  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  52.17 
 
 
144 aa  160  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  52.17 
 
 
144 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  52.17 
 
 
144 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  56.8 
 
 
148 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  57.86 
 
 
163 aa  159  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  51.45 
 
 
144 aa  158  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  50.69 
 
 
146 aa  158  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  50.38 
 
 
150 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  50.38 
 
 
150 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  50.38 
 
 
150 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  50.38 
 
 
150 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  53.62 
 
 
141 aa  157  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  50.38 
 
 
150 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  50.38 
 
 
150 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  50.38 
 
 
150 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  50.38 
 
 
150 aa  157  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  51.08 
 
 
145 aa  156  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  53.96 
 
 
159 aa  156  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  53.96 
 
 
159 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  50.74 
 
 
150 aa  155  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  51.8 
 
 
144 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  53.96 
 
 
158 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  52.59 
 
 
166 aa  154  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  49.64 
 
 
140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  49.64 
 
 
140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  49.31 
 
 
144 aa  153  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  54.68 
 
 
147 aa  153  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  54.07 
 
 
150 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  51.08 
 
 
158 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  53.73 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  47.95 
 
 
147 aa  150  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  53.9 
 
 
167 aa  149  8.999999999999999e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  54.29 
 
 
149 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  52.63 
 
 
162 aa  148  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  54.74 
 
 
149 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  52.17 
 
 
146 aa  147  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  48.55 
 
 
143 aa  147  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  52.52 
 
 
139 aa  147  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2650  general secretion pathway protein G  52.17 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  45.77 
 
 
146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  50.37 
 
 
209 aa  143  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  51.85 
 
 
156 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  51.82 
 
 
161 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  51.82 
 
 
152 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>