More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2540 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  63.38 
 
 		 148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  57.45 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  59.15 
 
 		 162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  48.51 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  46.48 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  45.77 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  46.76 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  43.51 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  40.4 
 
 		 169 aa  100  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  43.61 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  37.86 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  37.86 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  39.62 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  41.98 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  41.04 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  40.56 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.14 
 
 		 170 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  38.93 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  40.29 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  35.86 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.68 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  37.06 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.93 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0193  pilus assembly protein PilE  40.14 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  36.03 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  35.37 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  38.46 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  39.86 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  36.03 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  38.62 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.84 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0865  methylation site containing protein  39.55 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  39.01 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0853  methylation site containing protein  39.55 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0830  methylation site containing protein  39.55 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3224  type IV pilin  42.36 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  42.31 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  36.76 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  37.14 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0493  methylation  44.63 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  36.11 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  37.09 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  37.14 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  36.5 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  36.43 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  36.05 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  38.17 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  56.92 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  37.69 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  37.69 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  37.14 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  31.65 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1287  type 4 fimbrial biogenesis signal peptide protein  37.42 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3909  hypothetical protein  40.44 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.81 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2443  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103414  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  33.81 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  33.81 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  33.57 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  33.57 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  35.66 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0854  type IV pilin, putative  38.85 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4842  hypothetical protein  41.55 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0454526  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  30.91 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  32.86 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  32.86 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  35.66 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  30 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  30 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  35.82 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.45 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0710  methylation site containing protein  40.32 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3424  methylation site containing protein  40.32 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.7 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  34.72 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3312  methylation site containing protein  40.32 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.29 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  34.62 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0957  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.59 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296711 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  36.8 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0208  putative prepilin like protein  43.38 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0480818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  56.6 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  37.07 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  37.8 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0399  general secretion pathway protein H  39.31 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.57 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  31.88 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  61.7 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1384  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.88 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  37.86 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  31.88 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  59.57 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  41.38 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  50 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2839  protein involved in methylation  40.91 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  39.39 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  57.45 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  54.1 
 
 		 168 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  57.45 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>