247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3901 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  100 
 
 
148 aa  298  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  74.83 
 
 
151 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  74.83 
 
 
151 aa  204  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  68.79 
 
 
143 aa  193  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  50 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2673  putative type IV pilus biogenesis protein  48.94 
 
 
150 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2070  type IV pilus biogenesis protein, putative  48.94 
 
 
150 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3228  type IV pilus protein  48.94 
 
 
150 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.61962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3243  fimbrial protein pilin  48.94 
 
 
150 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3190  type IV pilus protein  48.94 
 
 
150 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0840  putative type IV pilus biogenesis protein  48.94 
 
 
150 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1384  type IV pilus biogenesis protein, putative  49.3 
 
 
150 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2443  hypothetical protein  48.92 
 
 
139 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103414  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3909  hypothetical protein  50.38 
 
 
154 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0777  putative Tfp pilus assembly protein PilE  44.14 
 
 
105 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1936  putative type IV pilus biogenesis protein  45.83 
 
 
133 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  40.56 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0325  hypothetical protein  42.22 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0808  hypothetical protein  42.22 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  40 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  37.01 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  35.85 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  32.87 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  32.87 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  35.86 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  38.41 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  32.58 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  36.6 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1287  type 4 fimbrial biogenesis signal peptide protein  35.57 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.54364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  33.56 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  34.62 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  34.25 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  36.69 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  35.71 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.06 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  33.09 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  34.53 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  35.66 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  32.65 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  32.65 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  29.66 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  29.3 
 
 
164 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  48.39 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  31.88 
 
 
150 aa  60.5  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  34.78 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  34.75 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  35.04 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  35.04 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0208  putative prepilin like protein  34.51 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0480818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  28.77 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.25 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3224  type IV pilin  35.77 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0193  pilus assembly protein PilE  35.81 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  35.96 
 
 
164 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  34.68 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  31.58 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  33.33 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  46.48 
 
 
198 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  32.56 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  42.86 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  29.41 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  30.87 
 
 
161 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  50.98 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  62.86 
 
 
198 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  62.86 
 
 
198 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  44.23 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  45.71 
 
 
198 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  45.71 
 
 
198 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  45.71 
 
 
198 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  28.91 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  47.73 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0399  general secretion pathway protein H  31.65 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  29.79 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0493  methylation  32.39 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0020  PilE protein  31.17 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  30.92 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  30.71 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  29.27 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  50 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  28.97 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2686  pilus assembly protein PilE  30.6 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  47.83 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  41.18 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  32.26 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  29.79 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0278  type IV pilin, putative  61.76 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  61.76 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  61.76 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  39.34 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  48.78 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  51.22 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  44.23 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  25.9 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  25.9 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  41.51 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  50 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  65.62 
 
 
199 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  58.82 
 
 
173 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  31.36 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  40.82 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>