More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1999 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  100 
 
 
131 aa  267  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  50 
 
 
135 aa  127  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  45.67 
 
 
138 aa  120  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  46.77 
 
 
137 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  43.28 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  52.27 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  42.97 
 
 
129 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  43.62 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  43.28 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  44.36 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  45.45 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  43.2 
 
 
122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  41.01 
 
 
153 aa  107  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  41.98 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  45.31 
 
 
133 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  39.2 
 
 
126 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  43.55 
 
 
138 aa  103  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  45.16 
 
 
124 aa  100  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  40.94 
 
 
131 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  39.06 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  39.06 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  43.48 
 
 
130 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  39.37 
 
 
124 aa  97.1  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  38.28 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  38.28 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  38.28 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  38.79 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  37.4 
 
 
129 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  40.18 
 
 
184 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  36.73 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  39.13 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  32.45 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  30.32 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  30.71 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  34.53 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  26.75 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  35.34 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  31.93 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  29.55 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  34.26 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  26.8 
 
 
170 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  31.09 
 
 
150 aa  60.1  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  29.13 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  31.41 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  34.65 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  33.98 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  34.07 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  34.62 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  32.69 
 
 
150 aa  58.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  28.85 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  34.62 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  30 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  29.13 
 
 
147 aa  57.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  28.21 
 
 
172 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  29.27 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  38.54 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  28.12 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  28.39 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  28.12 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  28.12 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  29.57 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  28.12 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  26.58 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  35.79 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  28.12 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  31.43 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  36.46 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  36.46 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  31.73 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  32.35 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  31.37 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  27.95 
 
 
177 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  25.47 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  30.94 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  30.48 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  30.48 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  28.33 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  49.09 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  31.43 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  30.48 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  28.33 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1088  hypothetical protein  36.78 
 
 
338 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.93 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  40.91 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  30.48 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  56.1 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>