192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0137 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  100 
 
 		 161 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  59.15 
 
 		 163 aa  201  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  56.96 
 
 		 177 aa  185  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  56.71 
 
 		 164 aa  185  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  51.22 
 
 		 161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  53.99 
 
 		 164 aa  156  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2998  hypothetical protein  56.88 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000440497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1285  hypothetical protein  56.25 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1461  hypothetical protein  52.83 
 
 		 162 aa  150  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  44.59 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  45.28 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  44.72 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  45.62 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  41.14 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  43.29 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  44.94 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  42.5 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  43.12 
 
 		 170 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  41.42 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  42.68 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  37.72 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2469  G protein signal peptide-like secretion type II protein  41.25 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3477  hypothetical protein  40.85 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103302  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2294  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  40.85 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2460  secretion type II protein  40.85 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  38.6 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  41.46 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  40.61 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  41.32 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  37.89 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  35.44 
 
 		 135 aa  85.5  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  34.64 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  35.53 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  37.09 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  34.39 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  33.55 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  34.62 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  33.97 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  34.81 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  32.9 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  30.97 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  33.54 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  31.41 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  32.03 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  32.9 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  33.97 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  32.45 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  31.87 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  30.43 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  30.72 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  30.59 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  32.89 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  34.62 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  33.04 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  26.51 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  29.05 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  36.11 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  33.96 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  31.78 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  31.78 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  43.1 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  32.46 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  28.68 
 
 		 130 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  28.95 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  41.38 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  33.05 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  34.71 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  30.97 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  32.2 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  32.2 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  31.19 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  31.9 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  28.3 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  28.93 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  27.97 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  32.91 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  28.3 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  31.19 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  28.7 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  31.36 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  24.64 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  28.83 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  29.36 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  33.04 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  32.26 
 
 		 362 aa  48.5  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  27.93 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  26.36 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  27.52 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  26.36 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  31.36 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  26.36 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  31.36 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  41.82 
 
 		 136 aa  47.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  26.61 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  27.93 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  41.07 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  31.36 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  28.95 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  30.84 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  28.18 
 
 		 154 aa  47.4  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>