154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2469 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2469  G protein signal peptide-like secretion type II protein  100 
 
 		 157 aa  316  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3477  hypothetical protein  89.1 
 
 		 159 aa  259  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103302  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2460  secretion type II protein  89.74 
 
 		 159 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2294  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  89.1 
 
 		 159 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  77.07 
 
 		 157 aa  249  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  63.87 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  52.63 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  52.94 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  53.21 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  51.92 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  50 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  51.61 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  53.46 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  48.08 
 
 		 170 aa  147  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  48.72 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  50.97 
 
 		 176 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  49.68 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  45.45 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  48.68 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  42.68 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  42.04 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  38.93 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  38.27 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1285  hypothetical protein  41.77 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2998  hypothetical protein  42.41 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000440497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  37.5 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  41.25 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  40.51 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1461  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  32.05 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  29.61 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  30.97 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  29.75 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  27.88 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  29.75 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  33.1 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  30.92 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  29.75 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  30.32 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  31.58 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  29.61 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  27.27 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  28.95 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  29.56 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  31.58 
 
 		 129 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  28.48 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  29.03 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  27.06 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  24.84 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  27.74 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  33.33 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  29.33 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  27.1 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  26.45 
 
 		 128 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  26.45 
 
 		 124 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  28.83 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  34.31 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  25.81 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  26.81 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  26.81 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  27.93 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  26.81 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  26.81 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  28.68 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  30.68 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  27.01 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  28.04 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  29.09 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  29.09 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  25.97 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  28.18 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  27.03 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  31.06 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  28.97 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  28.97 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  35.71 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  25.45 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  28.83 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  25.45 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  25.45 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  28.18 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  29.63 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  42.31 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  28.04 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  32.69 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  27.03 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  29.73 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  24.82 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  26.85 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  25.55 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  20.67 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  40.38 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  26.61 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  29.87 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  36.84 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>