More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1931 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  100 
 
 		 138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  65.91 
 
 		 135 aa  186  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  61.59 
 
 		 140 aa  182  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  58.39 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  56.08 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  62.12 
 
 		 135 aa  164  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  61.16 
 
 		 121 aa  163  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  55.38 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  51.94 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  46.03 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  44.27 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  47.2 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  44.88 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  46.88 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  46.09 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  46.09 
 
 		 128 aa  119  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  46.09 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  43.75 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  41.6 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  40.62 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  44.53 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  41.41 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  41.98 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  43.65 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  47.46 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  47.01 
 
 		 184 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  43.75 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  43.36 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  41.03 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  35.82 
 
 		 223 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  31.17 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  33.33 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  30.38 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  39.77 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  31.87 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  28.76 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  38.64 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  29.61 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  29.22 
 
 		 158 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  36 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  32.7 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  27.95 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  31.1 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  31.41 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  32.48 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  50.72 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.3 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  36.72 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  30.63 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.8 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  31.21 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  31.43 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.6 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  42.31 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  35.85 
 
 		 167 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  34 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  31.96 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  31.96 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  38.61 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  46.03 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  29.2 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  29.2 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  30.17 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  39.51 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  39.51 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.67 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  30.09 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  31.37 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  31.78 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  41.67 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  45.61 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  28.32 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  30.32 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  26.97 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  39.44 
 
 		 160 aa  57  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  37.5 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  37.18 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  45.59 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  35.35 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  31.37 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  27.52 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  31.37 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.62 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  31.37 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  31.01 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  31.25 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  31.37 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  28.81 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  42.42 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  29.41 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  38.71 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  31.78 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  31.37 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  28.32 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  37.88 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  33.02 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  29.7 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  28.81 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>