More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1440 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  100 
 
 		 131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  52.03 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  52.03 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  51.22 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  51.22 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  50 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  50.41 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  50.41 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  52.1 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  46.21 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  47.24 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  46.22 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  49.15 
 
 		 128 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  50.88 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  46.77 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  44.44 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  41.98 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  44.09 
 
 		 138 aa  104  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  43.94 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  40.94 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  41.73 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  45.45 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  36.42 
 
 		 153 aa  94.4  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  45.95 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  42.15 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  51.09 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  46.02 
 
 		 184 aa  92  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  50.55 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  35.25 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  35.61 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  30.97 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  34.85 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  30 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  36.76 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  34.85 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  39.18 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  40.82 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  38.46 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  38.32 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  37.06 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  29.81 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  38.78 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  38.32 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  32.86 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  34.65 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  36.76 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  33.07 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  33.07 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  33.07 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  33.07 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  36.92 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  37.5 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  40.4 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  37.78 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  40.82 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  36.72 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  32.67 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  27.5 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  35.35 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  33.82 
 
 		 158 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  32.28 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  32.85 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  37.76 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  32.28 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  32.28 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  33.96 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  39.56 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  38.18 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  40.91 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  41.76 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  33.87 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  35.54 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  32 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  33.12 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  34.65 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  33.07 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  37.01 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  37 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  32.62 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  31.74 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  36.54 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  31.87 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1528  general secretion pathway protein G  45.95 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.430889 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  41.54 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>