More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02979 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  56.78 
 
 		 133 aa  141  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  55.56 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  55.46 
 
 		 138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  54.24 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  55.08 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  55.17 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  50.43 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  49.57 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  49.57 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  49.14 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  54.7 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  56.76 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  48.7 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  51.69 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  45.53 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  46.77 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  55.67 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  49.48 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  43.44 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  46.77 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  40 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  40.62 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  44.26 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  43.8 
 
 		 184 aa  107  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  40.68 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  47.73 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  37.4 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  42.62 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  38.17 
 
 		 223 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  38.71 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.25 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  35.65 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.8 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  43.08 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  32 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.21 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.37 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  33.77 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  31.37 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  35.33 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  32 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  29.23 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  29.69 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  40.58 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  28.46 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  43.08 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  30.39 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  32.04 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.29 
 
 		 175 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.46 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  35.33 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  29.46 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  38.46 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  33.11 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  29.93 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  31.63 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  32.95 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  31.63 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  31.61 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  31.63 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  31.63 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  31.63 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  31.63 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  28.95 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  34.41 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  31.63 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1088  hypothetical protein  33.7 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  33.8 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.54 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  31.63 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  31.94 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  32.43 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  32.58 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  38.02 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  31.91 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  31.91 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  31.91 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  32.58 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  28.03 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  31.91 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  31.91 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  31.91 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  31.91 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  27.93 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  27.93 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  32.89 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  28.12 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  27.93 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  27.93 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  33.8 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  31.07 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  27.93 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  27.93 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  36.11 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  27.2 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>