80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1461 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1461  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  331  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  62.42 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  62.11 
 
 		 164 aa  216  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  58.75 
 
 		 161 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  62.42 
 
 		 164 aa  198  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1285  hypothetical protein  57.96 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2998  hypothetical protein  56.69 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000440497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  54.72 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  46.79 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  46.71 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  46.84 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  42.33 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  41.51 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  43.04 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  44.38 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  40.61 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  41.88 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  43.64 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  44.03 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  40.62 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  41.46 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3477  hypothetical protein  40.62 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103302  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2460  secretion type II protein  41.25 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2294  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  40.62 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2469  G protein signal peptide-like secretion type II protein  40 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  42.86 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  39.75 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  38.1 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  41.21 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  30.54 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  33.75 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  30.19 
 
 		 131 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  31.29 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  34.32 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  31.9 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  28.93 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  29.01 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  28.3 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  30.3 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  28.12 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  28.39 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  26.28 
 
 		 122 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  30.06 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  30.46 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  27.61 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  27.39 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  30 
 
 		 124 aa  51.6  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  25.79 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  25.79 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  26.38 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  25.16 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  32.41 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  25.16 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  25.45 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  27.27 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  23.49 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  23.49 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  23.49 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  24.86 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  30.26 
 
 		 313 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  34.55 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  34.55 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  28.97 
 
 		 130 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  36.54 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  27.1 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  31.4 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  26.85 
 
 		 140 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  26.85 
 
 		 140 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  22.22 
 
 		 338 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  27.74 
 
 		 223 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  38.6 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  26.89 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  27.87 
 
 		 326 aa  41.6  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  27.52 
 
 		 166 aa  41.2  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  26.98 
 
 		 301 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  30.77 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  28.57 
 
 		 323 aa  40.8  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3737  type II secretion pathway protein XcpT  36.36 
 
 		 212 aa  40.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>