More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2471 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  100 
 
 
338 aa  695    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  42.81 
 
 
353 aa  235  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  35.25 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  34.55 
 
 
323 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  35.73 
 
 
362 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  35.15 
 
 
326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  35.73 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  34.77 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  32.88 
 
 
348 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1627  protein of unknown function DUF1559  34.19 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.673942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3825  protein of unknown function DUF1559  36.69 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  32.56 
 
 
324 aa  125  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  36.29 
 
 
349 aa  122  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  32.24 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3724  protein of unknown function DUF1559  33.99 
 
 
333 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0072  protein of unknown function DUF1559  32.97 
 
 
318 aa  119  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0793398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1302  protein of unknown function DUF1559  34.25 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0844  protein of unknown function DUF1559  34.24 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0876  protein of unknown function DUF1559  34.33 
 
 
386 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  35.63 
 
 
330 aa  115  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2549  protein of unknown function DUF1559  33.24 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3621  protein of unknown function DUF1559  34.34 
 
 
337 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0027  protein of unknown function DUF1559  31.67 
 
 
331 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.13205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0375  protein of unknown function DUF1559  34.05 
 
 
328 aa  112  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000847182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3726  protein of unknown function DUF1559  34.66 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0161  protein of unknown function DUF1559  39.13 
 
 
361 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0998641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4084  protein of unknown function DUF1559  35.19 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2542  protein of unknown function DUF1559  33.87 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.192692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2789  protein of unknown function DUF1559  33.63 
 
 
319 aa  109  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.909161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4221  protein of unknown function DUF1559  38.55 
 
 
346 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2824  protein of unknown function DUF1559  31.71 
 
 
309 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2094  protein of unknown function DUF1559  33.24 
 
 
314 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.136173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1767  protein of unknown function DUF1559  31.64 
 
 
359 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2092  protein of unknown function DUF1559  34.52 
 
 
327 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.125641  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2788  protein of unknown function DUF1559  33.73 
 
 
312 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2813  protein of unknown function DUF1559  31.86 
 
 
339 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2935  protein of unknown function DUF1559  33.68 
 
 
366 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0697  protein of unknown function DUF1559  30.75 
 
 
366 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3907  protein of unknown function DUF1559  34.06 
 
 
340 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.279365  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0949  protein of unknown function DUF1559  34.46 
 
 
318 aa  106  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3492  protein of unknown function DUF1559  51.57 
 
 
354 aa  106  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2547  protein of unknown function DUF1559  35.08 
 
 
336 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.721774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1625  protein of unknown function DUF1559  32.34 
 
 
332 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4083  protein of unknown function DUF1559  40.32 
 
 
367 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0086  protein of unknown function DUF1559  32.27 
 
 
345 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.806187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4238  protein of unknown function DUF1559  40 
 
 
350 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000246422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0947  protein of unknown function DUF1559  33.98 
 
 
324 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0160  protein of unknown function DUF1559  48.39 
 
 
362 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000196505  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2578  protein of unknown function DUF1559  32.76 
 
 
292 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3345  protein of unknown function DUF1559  32.72 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0547  protein of unknown function DUF1559  35.44 
 
 
358 aa  96.3  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0841424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3708  protein of unknown function DUF1559  31.25 
 
 
325 aa  96.3  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0162  protein of unknown function DUF1559  62.86 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.333939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2417  protein of unknown function DUF1559  38.52 
 
 
245 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  32.73 
 
 
326 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0304  protein of unknown function DUF1559  28.12 
 
 
377 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2459  protein of unknown function DUF1559  27.91 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1619  protein of unknown function DUF1559  47.59 
 
 
361 aa  89.7  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3656  protein of unknown function DUF1559  48 
 
 
369 aa  89  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4047  protein of unknown function DUF1559  38.02 
 
 
351 aa  86.3  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2901  protein of unknown function DUF1559  30.75 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1018  protein of unknown function DUF1559  25.58 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3195  protein of unknown function DUF1559  25.23 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.967347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0377  protein of unknown function DUF1559  36.1 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000309898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3394  protein of unknown function DUF1559  34.04 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  75.36 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3827  protein of unknown function DUF1559  45.27 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3829  hypothetical protein  35.66 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3401  protein of unknown function DUF1559  31.74 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  50 
 
 
352 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  48.33 
 
 
219 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2888  hypothetical protein  67.24 
 
 
431 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0559455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  36.59 
 
 
154 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  35.8 
 
 
150 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  34.52 
 
 
150 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  34.15 
 
 
158 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  36.71 
 
 
154 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  34.57 
 
 
150 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  34.57 
 
 
150 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  39.02 
 
 
143 aa  55.8  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  35.56 
 
 
149 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  43.94 
 
 
131 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  35.11 
 
 
149 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 
165 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 
150 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  42.19 
 
 
129 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 
150 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 
150 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 
150 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 
150 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 
150 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 
150 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  35.06 
 
 
150 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  32.5 
 
 
155 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  32.1 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  32.1 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  32.1 
 
 
150 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  30 
 
 
213 aa  53.1  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.836377 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  36.76 
 
 
138 aa  52.8  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0563  hypothetical protein  42.65 
 
 
227 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.731892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>