100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2302 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  100 
 
 		 172 aa  346  8e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  69.62 
 
 		 176 aa  222  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  56.13 
 
 		 168 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  53.25 
 
 		 161 aa  173  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  54.14 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  51.92 
 
 		 160 aa  167  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  50 
 
 		 172 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  51.63 
 
 		 158 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  50.63 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  51.3 
 
 		 159 aa  154  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  53.12 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  48.39 
 
 		 170 aa  148  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2294  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  51.57 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2460  secretion type II protein  51.92 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3477  hypothetical protein  50.94 
 
 		 159 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103302  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  44.3 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2469  G protein signal peptide-like secretion type II protein  51.92 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  44.87 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  43.23 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  43.45 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  42.31 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  42.11 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1285  hypothetical protein  45.62 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  38.41 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2998  hypothetical protein  44.38 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000440497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  43.29 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  38.79 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  43.12 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1461  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  84  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  35.48 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  33.33 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  30.43 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  33.96 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  31.37 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  31.82 
 
 		 128 aa  67  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  33.99 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  35.26 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  31.61 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  32.68 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  32.05 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  31.41 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  32.05 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  31.41 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  27.95 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  29.14 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  32.3 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  31.37 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  30.82 
 
 		 128 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  35.33 
 
 		 129 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  30.52 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  30.77 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  30.13 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  27.39 
 
 		 131 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  34.04 
 
 		 124 aa  48.5  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  38.89 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  29.11 
 
 		 223 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  25.48 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  35.19 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  37.04 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  31.82 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  34.55 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  37.5 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  25.17 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  28.91 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  33.98 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  27.94 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  31.25 
 
 		 130 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  39.29 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  29.93 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  23.4 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  35.51 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  33.33 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  30.41 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  25.18 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  26.53 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  28.8 
 
 		 143 aa  42  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1273  competence protein ComGC  34.38 
 
 		 129 aa  42  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0185017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  36.67 
 
 		 169 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  31.17 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  26.96 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  33.13 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  27.66 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  27.33 
 
 		 121 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  30.4 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  23.45 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.6 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  26.9 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  27.59 
 
 		 136 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  32.73 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  23.53 
 
 		 162 aa  41.2  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  32.5 
 
 		 154 aa  40.8  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  28.28 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  28.28 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  28.48 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>