85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1273 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1273  competence protein ComGC  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0185017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0555  competence protein ComGC-like protein  41.57 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2926  ComG operon protein 3  41.33 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.972463  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  39.02 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0206  DNA transport machinery (exogenous DNA-binding protein)  36.62 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2369  ComG operon protein 3  29.27 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  37.5 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  37.04 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4319  comG operon protein 3  31.82 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4372  comG operon protein 3  31.82 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4095  comG operon protein 3  32.95 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.663959  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  50 
 
 		 349 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  40.3 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  40.3 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  40.3 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  38.57 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  34.34 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  34.34 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  35.35 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  35.35 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  50 
 
 		 323 aa  44.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  50 
 
 		 313 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  47.5 
 
 		 326 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3110  protein of unknown function DUF1559  47.62 
 
 		 353 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3983  comG operon protein 3  33.33 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0155019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4262  comG operon protein 3  33.33 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4464  ComG operon protein 3  33.33 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  33.71 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  34.62 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  32.05 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  51.52 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  36 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  51.52 
 
 		 325 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  51.52 
 
 		 323 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  34.48 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4143  comG operon protein 3  33.33 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  34.62 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  34.38 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  34.62 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  34.09 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  36.23 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  50 
 
 		 362 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  50 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  33.33 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  50 
 
 		 324 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  39.22 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  40 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 		 193 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  44.44 
 
 		 348 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  34.62 
 
 		 128 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  38.67 
 
 		 122 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  42 
 
 		 142 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  34.38 
 
 		 172 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2572  putative type IV pilin  37.25 
 
 		 140 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  31.25 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  32.79 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2274  prepilin peptidase dependent protein A precursor  38.46 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  51.52 
 
 		 321 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  32.1 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  34 
 
 		 227 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  32.22 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  41.18 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  32.2 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  32.2 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  42.11 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3525  hypothetical protein  47.5 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00449865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  41.86 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  43.59 
 
 		 157 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  37.97 
 
 		 129 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  30 
 
 		 164 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.38 
 
 		 187 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>