55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0672 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  440  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  99.55 
 
 		 225 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  66.21 
 
 		 217 aa  284  8e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  61.06 
 
 		 282 aa  265  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  55.79 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  53.1 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  52.7 
 
 		 226 aa  214  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  52.94 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0761  methylation precursor  56.25 
 
 		 238 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  38.29 
 
 		 232 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  39.07 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  37.4 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  35.04 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  34.81 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  32.35 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  35.65 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  32.65 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  29.41 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  40 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  39.68 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  38.33 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  40 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  36.36 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  30.95 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  29.85 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  36 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  43.75 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  36.99 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  38.81 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  37.7 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  38.71 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  32.5 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  34 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  32.5 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  32.5 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  32.5 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  32.5 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  32.5 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  38.6 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  38.33 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  38.33 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  36.84 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  25 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  34.43 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  28.79 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  35 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  34.33 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  30.25 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  38.1 
 
 		 126 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  39.62 
 
 		 144 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  39.62 
 
 		 144 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  34.19 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  32.84 
 
 		 259 aa  42  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>