94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0147 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  34.23 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  35.2 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  32.46 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  30.77 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  31.05 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  28.82 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  28.85 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  28.12 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  34.21 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  34.44 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  31.05 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  29.41 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  29.02 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  29.9 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  27.18 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  30.3 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  28.79 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  32.09 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  27.11 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  25.94 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  30.57 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  26.73 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  29.38 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  27.86 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  32.52 
 
 		 199 aa  62  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  30.54 
 
 		 221 aa  62  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  29.26 
 
 		 205 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  32.52 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  33.79 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  27.37 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  26.7 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.82 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  29.88 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  31.9 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  28.43 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  35.04 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  27.84 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  24.46 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  28.5 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  27.43 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  27.27 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  34.35 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  27.92 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  27.78 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  27.78 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  36.17 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  27.78 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  25.34 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  32.54 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  29.94 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  30 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  29.94 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  34.38 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  32.54 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  33.59 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  26.83 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  33.59 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  33.59 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  24.75 
 
 		 212 aa  52.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  33.04 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  33.86 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  33.86 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  33.86 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  19.71 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  29.84 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  37.5 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1035  hypothetical protein  24.27 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  19.23 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  35.35 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  37.88 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3310  Type II secretory pathway component PulJ-like protein  25.51 
 
 		 181 aa  49.3  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  29.91 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  34 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  25.74 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  30.46 
 
 		 189 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  31.15 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0714  hypothetical protein  25.6 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0511321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0724  hypothetical protein  35.94 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521463  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  32.5 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  28.65 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  35.71 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  26.89 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  35.71 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  26.89 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  26.89 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  26.89 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0715  hypothetical protein  26.01 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  29.69 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0680  hypothetical protein  25.65 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.197262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  29.53 
 
 		 187 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.5 
 
 		 145 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  36.84 
 
 		 226 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  26.29 
 
 		 195 aa  42  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>