54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1010 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 198 aa  400  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  99.49 
 
 		 198 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3264  general secretion pathway protein J  90.84 
 
 		 131 aa  246  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089395  hitchhiker  0.00000000000000309054 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  26.56 
 
 		 216 aa  94.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  27.08 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  30.35 
 
 		 237 aa  93.2  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  30.37 
 
 		 199 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  29.29 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  27.6 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  25.89 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  27.78 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  25.89 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  29.15 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  26.13 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  25.52 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  25.52 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  27.72 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  24.21 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  24.32 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  26.02 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  23.68 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  28.27 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  23.78 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  27.55 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  20.2 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  23.7 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  27.04 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  25.36 
 
 		 254 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  26.4 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  29.01 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  25.89 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  25.38 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  22.61 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  21.61 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  25.25 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  24.75 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  23.47 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  24.75 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  25 
 
 		 253 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  24.37 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  25 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  24.49 
 
 		 259 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3310  Type II secretory pathway component PulJ-like protein  24.1 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  24.49 
 
 		 263 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  24.49 
 
 		 259 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  24.49 
 
 		 257 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  25.26 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  24.37 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  19.23 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  21.35 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  22.78 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  23.12 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  22.38 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3370  N-terminal methylation  22.03 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.306452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>