70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3574 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 212 aa  436  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  28.57 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  28.08 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  28.9 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  27.01 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  27.8 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  27.4 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  29.33 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  25.82 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  26.04 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  28.86 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  25.52 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  25.24 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  24.51 
 
 		 237 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  27.5 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  29.79 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  26.21 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  27.54 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  27.05 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  27.54 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  27.05 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  26.57 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  25.23 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  27.59 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  24.06 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  25.67 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  24.51 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  27.19 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  25.89 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  25.35 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  27.83 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  24.75 
 
 		 253 aa  52.4  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  27.23 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  25.84 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  25.13 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  27.17 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  24.15 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  28.3 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  24.86 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  41.38 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  27.1 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  26.54 
 
 		 264 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  26.32 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  23.28 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  26.79 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  29.92 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  24.19 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  25.84 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  25.84 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  33.73 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  25.84 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  26.76 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  25.84 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  37.1 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  38.46 
 
 		 282 aa  45.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.15 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  38.18 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  22.56 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  36.84 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3264  general secretion pathway protein J  25.74 
 
 		 131 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089395  hitchhiker  0.00000000000000309054 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  30.51 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  30.51 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  30.51 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  30.51 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  30.51 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  22.56 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  26.74 
 
 		 291 aa  42.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0724  hypothetical protein  39.53 
 
 		 239 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521463  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  25.15 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  26.32 
 
 		 259 aa  42  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>