69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3421 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  99.5 
 
 		 199 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  97.99 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  96.98 
 
 		 201 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  98.93 
 
 		 189 aa  377  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  98.38 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  34.83 
 
 		 215 aa  124  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  35.18 
 
 		 237 aa  124  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  36.04 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  38.38 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  36 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  35.79 
 
 		 216 aa  117  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  35.05 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  35.03 
 
 		 250 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  34.54 
 
 		 219 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  35.18 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  33.82 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  36.22 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  35.03 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  37.89 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  33 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  33.17 
 
 		 237 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  34.55 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  33.98 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  34.55 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  34.55 
 
 		 259 aa  98.2  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  33.51 
 
 		 259 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  33.51 
 
 		 257 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  33.51 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  33.51 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  33.84 
 
 		 255 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  32.66 
 
 		 255 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  31.98 
 
 		 252 aa  94.7  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  32.64 
 
 		 264 aa  94.7  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  30.73 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  32.66 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  32.66 
 
 		 253 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  31.68 
 
 		 239 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  26.63 
 
 		 198 aa  84.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  25.89 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  29.65 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  29.95 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  32.62 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  30.54 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  27.05 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  34.25 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  23.65 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  29.7 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  23.65 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.55 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  31.9 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  26.96 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3310  Type II secretory pathway component PulJ-like protein  26.57 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  24.74 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  24.74 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  24.74 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  24.74 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  24.74 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  32.35 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  30.82 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3264  general secretion pathway protein J  25.22 
 
 		 131 aa  48.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089395  hitchhiker  0.00000000000000309054 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  38.46 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  37.29 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  37.29 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  30.07 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  39.13 
 
 		 230 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  29.36 
 
 		 227 aa  41.2  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>