62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1895 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  100 
 
 
206 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  27.67 
 
 
239 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  29.95 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  25.67 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  26.88 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  27.42 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  27 
 
 
197 aa  58.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  26.96 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  22.77 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  26.96 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  26.96 
 
 
199 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  22.28 
 
 
205 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  25.35 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  26.47 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  33.33 
 
 
240 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  34.45 
 
 
247 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  21.13 
 
 
216 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  21.84 
 
 
250 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  35.48 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  39.68 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  26.79 
 
 
223 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  40.28 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  38.81 
 
 
282 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  19.91 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  27.96 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  40.35 
 
 
225 aa  48.5  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  22.17 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  20.1 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  40.35 
 
 
242 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  40.35 
 
 
242 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  40.35 
 
 
242 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  25.73 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  37.1 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  21.74 
 
 
225 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  40.68 
 
 
234 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  25.74 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  35.94 
 
 
226 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  28.12 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  26.32 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  26.32 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  40 
 
 
242 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  40 
 
 
242 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  40 
 
 
242 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  35.38 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  41.07 
 
 
235 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  36.07 
 
 
232 aa  45.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  26.48 
 
 
223 aa  45.4  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  25.25 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  38.96 
 
 
198 aa  45.1  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  20.87 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  33.8 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  35 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  31.63 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  37.1 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  35 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  35 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  25.25 
 
 
193 aa  42.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  30.86 
 
 
203 aa  42.4  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  24.49 
 
 
187 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  31.75 
 
 
230 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  22.6 
 
 
246 aa  41.2  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>