75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2918 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  54.03 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  54.15 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  53.96 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  40.38 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  38.78 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  37.69 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  37.93 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  36.45 
 
 		 237 aa  147  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  38.38 
 
 		 246 aa  144  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  34.98 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  34.83 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  37.95 
 
 		 259 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  34.83 
 
 		 199 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  34.48 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  36.73 
 
 		 259 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  36.41 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  38.07 
 
 		 199 aa  131  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  34.31 
 
 		 232 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  35.71 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  37.31 
 
 		 250 aa  128  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  34.03 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  35.26 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  35.94 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  34.18 
 
 		 252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  35.71 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  33.02 
 
 		 257 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  33.86 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  33.01 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  33.01 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  33.01 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  35.05 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  35.42 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  35.42 
 
 		 253 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  29.35 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  27.23 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  28.14 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  27.64 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  28.64 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  26.11 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  28.23 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  27.93 
 
 		 198 aa  72  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  27.18 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  27.19 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  26.67 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  28.14 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  26.67 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  28.14 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  28.14 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  28.14 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  28.14 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  26.19 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  27.45 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.17 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  28 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  25.51 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3310  Type II secretory pathway component PulJ-like protein  22.33 
 
 		 181 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  30.23 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  25 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  21.84 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  27.59 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  30.65 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  37.14 
 
 		 127 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  28.68 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  27.91 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3370  N-terminal methylation  23.78 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.306452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  34.43 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  38 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  34.48 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  37.7 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2614  putative general secretion pathway protein J  23.04 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3264  general secretion pathway protein J  25.21 
 
 		 131 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089395  hitchhiker  0.00000000000000309054 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  32.56 
 
 		 202 aa  41.6  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  37.1 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.836377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>