87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2920 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  61 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  60.8 
 
 		 237 aa  235  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  42.16 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  38.89 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  34.12 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  34.26 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  31.34 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  38.34 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  36.28 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  31.75 
 
 		 208 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  32.54 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  39.15 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  34.32 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  32.68 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  34.31 
 
 		 257 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  33.18 
 
 		 259 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  33.49 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  36.67 
 
 		 198 aa  98.6  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  32.74 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  32.74 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  33.48 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  32.76 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  33.03 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  33.66 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  33.17 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  33.98 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  32.06 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  33.5 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  32.86 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  32.55 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  32.85 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  31.19 
 
 		 216 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  32.49 
 
 		 237 aa  92  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  32.67 
 
 		 259 aa  92  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  31.58 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  31.84 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  31.98 
 
 		 216 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  31.68 
 
 		 199 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  31.68 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  37.19 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  25.76 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  34.48 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  34.67 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  27.92 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  27.92 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  29.65 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  25.82 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  29.44 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  29.83 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  27.67 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.43 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  20.71 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  20.2 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  27.47 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  27.95 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  35.86 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  28.92 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  32.96 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  29 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  29 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  29 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  29 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  29 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  42.86 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  40 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  36.36 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  36.36 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  33.58 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  39.71 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  29.05 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  56.76 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3310  Type II secretory pathway component PulJ-like protein  26.77 
 
 		 181 aa  46.6  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2553  Type II secretory pathway component PulJ-like  29.63 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  30.58 
 
 		 228 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  32.31 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  33.85 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  38.6 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  44.9 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  30.7 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  28.37 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  37.5 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  31.67 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1035  hypothetical protein  49.23 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  45.45 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  27.42 
 
 		 232 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>