32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0234 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  45.23 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  35.71 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  34.48 
 
 		 239 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  32.38 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  30.35 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  30.85 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  32.7 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  28.85 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  26.29 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  26.29 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  26.29 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  26.29 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  25.85 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  25.85 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  27.4 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  25.77 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  25.73 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  30.08 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  26.85 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  26.67 
 
 		 246 aa  49.3  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  33.08 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  26.42 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  29.9 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  26.7 
 
 		 250 aa  47.8  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  26.79 
 
 		 232 aa  47.8  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  26.73 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  27.42 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  25.25 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  36.07 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  25.52 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  25.52 
 
 		 187 aa  41.6  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>