73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1410 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 199 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  38.89 
 
 		 239 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  34.02 
 
 		 237 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  32.82 
 
 		 237 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  34.95 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  31.1 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  30.1 
 
 		 254 aa  85.1  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  33.17 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  29.77 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  30.05 
 
 		 251 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  27.14 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  29.65 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  29.65 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  28.64 
 
 		 250 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  29.15 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  27.72 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  27.86 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  29.65 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  26.73 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  29.7 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  27.86 
 
 		 253 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  31.82 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  28.02 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  27.64 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  28.36 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  30.65 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  28.86 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  28.02 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  28.02 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  29.79 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  28 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  27.5 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  27.86 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  31.19 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  25.46 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  27.64 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  28.5 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  27.87 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  23.38 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  28.43 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  32.04 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  22.89 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  28.27 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  27.78 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  27.86 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  40.58 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  27.89 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  23.86 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  31.09 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  23.86 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  23.86 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  23.86 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  23.86 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  39.13 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  25.77 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  25.26 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  27.96 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  36.51 
 
 		 291 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  39.29 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  30.38 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.76 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0683  general secretion pathway protein J  35.29 
 
 		 234 aa  44.7  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  31.15 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  30.65 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  27.42 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  33.93 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  30.43 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  31.15 
 
 		 240 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3310  Type II secretory pathway component PulJ-like protein  23.96 
 
 		 181 aa  42  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1104  prepilin-type cleavage/methylation  23.32 
 
 		 176 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.945124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1522  putative pseudopilin J precursor  32.94 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215294  normal  0.316231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3370  N-terminal methylation  38.33 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.306452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>