88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2375 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 223 aa  434  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  47.12 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  35.71 
 
 		 193 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  37.19 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  35.48 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  35.88 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  33.52 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  36.99 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  34.44 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  30.43 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  34.25 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  34.25 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  34.25 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  33.7 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  30.77 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  30.77 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  32.43 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  34.35 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  33.59 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  35.82 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  31.76 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  33.59 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  33.59 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  33.08 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  27.19 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  40.58 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  28.57 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  30.83 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  32.37 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  32.82 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  33.08 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  32.82 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  30.95 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  32.45 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  30.58 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  25 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  29.41 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  29.41 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  25 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  29.85 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  29.41 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  29.41 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  31.58 
 
 		 255 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  28.65 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  30.54 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  41.27 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  31.47 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  28.68 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  33.58 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  30.66 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  41.79 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  32.81 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  29.45 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  35.82 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  31.01 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  50 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  30.3 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  50 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  37.14 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  48.84 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  38.71 
 
 		 291 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  26.67 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  50 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  51.22 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  26.48 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  29.45 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  27.64 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1027  hypothetical protein  36.67 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  25.56 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  46.67 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  46.67 
 
 		 129 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  32.53 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0724  hypothetical protein  38.71 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521463  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  33.87 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  31.96 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1035  hypothetical protein  37.93 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0715  hypothetical protein  40.3 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3370  N-terminal methylation  40.32 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.306452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0680  hypothetical protein  40.3 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.197262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  38.64 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  37.04 
 
 		 134 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  34 
 
 		 161 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  32.5 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  30.3 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  31.25 
 
 		 171 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  41.86 
 
 		 252 aa  42  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  35.48 
 
 		 247 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>