51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0056 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  100 
 
 
231 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  88.74 
 
 
229 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  88.89 
 
 
234 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  90.09 
 
 
222 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  89.66 
 
 
232 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  88.64 
 
 
224 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  89.19 
 
 
222 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  70.25 
 
 
242 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  70.25 
 
 
242 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  70.25 
 
 
242 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  70.25 
 
 
242 aa  334  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  70.25 
 
 
242 aa  334  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  70.25 
 
 
242 aa  334  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  70.66 
 
 
242 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  75.86 
 
 
203 aa  315  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  63.64 
 
 
228 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  62.39 
 
 
234 aa  287  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  65.17 
 
 
201 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  36.63 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  34.1 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  32.35 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  28.57 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  33.14 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  30.06 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  31.25 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  31.54 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  33.15 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  30.37 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  32.35 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  24.5 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  33.06 
 
 
282 aa  55.1  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  34.38 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  34.11 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  30.89 
 
 
235 aa  52  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  29.34 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  37.7 
 
 
227 aa  48.9  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  38.6 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  30.87 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.77 
 
 
146 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  39.02 
 
 
145 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  39.13 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  35.38 
 
 
206 aa  45.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  50 
 
 
223 aa  45.8  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  25.71 
 
 
291 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  46.15 
 
 
223 aa  45.4  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  35.48 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  38.04 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.33 
 
 
142 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  33.33 
 
 
161 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  30.77 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2930  type IV pilus assembly protein  64 
 
 
149 aa  41.6  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>