50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3237 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  100 
 
 		 229 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  94.59 
 
 		 222 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  94.4 
 
 		 232 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  88.74 
 
 		 231 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  89.32 
 
 		 234 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  94.14 
 
 		 222 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  89.09 
 
 		 224 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  72.31 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  72.31 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  72.31 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  72.31 
 
 		 242 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  72.31 
 
 		 242 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  72.31 
 
 		 242 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  71.9 
 
 		 242 aa  331  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  77.83 
 
 		 203 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  64.63 
 
 		 228 aa  297  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  61.54 
 
 		 234 aa  278  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  64.18 
 
 		 201 aa  268  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  34.55 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  37.04 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  33.14 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  33.54 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  29.24 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  31.62 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  30.06 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  32.19 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  32.57 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  28.57 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  32.31 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  29.94 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  34.62 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  22.93 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  28.57 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  33.9 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  31.93 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  36.63 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  28.14 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  33.33 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  31.16 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  42.65 
 
 		 146 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  51.22 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  26.89 
 
 		 291 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  46.15 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  33.82 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  35 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  41.79 
 
 		 187 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  35.53 
 
 		 159 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  33.82 
 
 		 161 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  28.29 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  42.03 
 
 		 130 aa  41.6  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>