64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3394 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  100 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  95.14 
 
 		 240 aa  460  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  80.16 
 
 		 240 aa  350  8.999999999999999e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  44.22 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  43.97 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  37.22 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  36.84 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  30.6 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  37.5 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  37.5 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  37.5 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  36.09 
 
 		 242 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  37.35 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  37.35 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  37.35 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  33.74 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  34.36 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  41.98 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  33.14 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  34.57 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  33.53 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  33.54 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  36.69 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  35.22 
 
 		 203 aa  72  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  36 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  35.34 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  36 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  44.62 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  32.65 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  31.43 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  33.95 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  33.95 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  28.23 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  29.63 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  37.5 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  28.05 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  38.03 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  34.45 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  46.43 
 
 		 213 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  26 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  33.87 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  42.37 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  42.37 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  38.36 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  29.91 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  35 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  29.05 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  31.75 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  37.29 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  27.91 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  37.29 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  37.29 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  37.29 
 
 		 199 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  29.37 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  30 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  39.47 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  30.56 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  34.43 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  30.65 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  31.67 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  37.61 
 
 		 182 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  28.12 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>