28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4494 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  100 
 
 
201 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  91.54 
 
 
228 aa  362  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  78.61 
 
 
234 aa  321  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  69.15 
 
 
242 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  69.15 
 
 
242 aa  291  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  69.15 
 
 
242 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  69.15 
 
 
242 aa  291  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  69.15 
 
 
242 aa  291  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  69.15 
 
 
242 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  69.15 
 
 
203 aa  290  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  68.66 
 
 
242 aa  289  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  65.17 
 
 
231 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  64.18 
 
 
222 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  65.17 
 
 
234 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  64.68 
 
 
224 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  64.18 
 
 
229 aa  268  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  63.83 
 
 
232 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  63.83 
 
 
222 aa  255  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  31.91 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  33.53 
 
 
240 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  33.53 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  32.93 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  27.78 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  25 
 
 
212 aa  62  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  28.23 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  26.55 
 
 
191 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  26.32 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  27.78 
 
 
215 aa  41.6  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>