52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5692 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  464  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  53.88 
 
 		 282 aa  254  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  55.79 
 
 		 227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  55.31 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  51.34 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  47.66 
 
 		 235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  51.3 
 
 		 226 aa  215  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0761  methylation precursor  48.51 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  43.81 
 
 		 227 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  36.65 
 
 		 215 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  33.19 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  36.91 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  36.69 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  32.64 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  31.58 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  31.88 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  31.88 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  31.88 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  31.88 
 
 		 242 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  31.88 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  31.88 
 
 		 242 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  31.88 
 
 		 242 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  32.35 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  31.76 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  31.78 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  32.54 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  32.19 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  40 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  33.33 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  38.71 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  40.58 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  30.37 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  40.35 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  42.37 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  35.48 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  42.86 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  29.37 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  36.67 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  37.5 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.78 
 
 		 142 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  35.71 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0777  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  30.4 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  38.3 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  35.85 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  32.79 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  28.23 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  38.89 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  29.69 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  32.31 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  31.76 
 
 		 232 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  31.76 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  30.34 
 
 		 198 aa  41.6  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>