62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3196 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  48.28 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  46.6 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  41.12 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  31.25 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  32.43 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  33.85 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  28.57 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  31.3 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  31.54 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  31.54 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  31.54 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  31.54 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  31.54 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  31.54 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  29.31 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  27.32 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  27.98 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  32.31 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  30.36 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  32.81 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  31.06 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  28.92 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  38.03 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  43.1 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  28.79 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  28.79 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  26.94 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  26.01 
 
 		 228 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  32.48 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  40 
 
 		 282 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  27.33 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  36.23 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  28 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  36.99 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  36 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  26.15 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  32.81 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  26.92 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  26.92 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  26.92 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  26.92 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  36.51 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  26.32 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  37.7 
 
 		 291 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  27.98 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  28.46 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  26.46 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  23.38 
 
 		 254 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  26.84 
 
 		 250 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  44.9 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  27.75 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  29.69 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  30.43 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  31.75 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  33.85 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  25.15 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  33.85 
 
 		 232 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  32.56 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>