40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1324 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1324  methylation  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  59.48 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  53.91 
 
 		 282 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  47.66 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0761  methylation precursor  57.39 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  50.45 
 
 		 217 aa  207  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  53.1 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  52.91 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  48.88 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  36.94 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  37.23 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  49.21 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  48.39 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  44.62 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  34.4 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  41.94 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  41.94 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  40 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  38.6 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  38.6 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  38.6 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  38.6 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  38.6 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  38.6 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  30.89 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  30.08 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  51.79 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  38.81 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  30.08 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  37.88 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  36.51 
 
 		 202 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  29.06 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  42.37 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  40 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  37.5 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  41.07 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  38.18 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  29.69 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  37.5 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>