48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3131 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 215 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  51.85 
 
 		 232 aa  211  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  37.22 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  37.56 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  37.04 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  39.07 
 
 		 227 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  39.23 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  35.98 
 
 		 282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  37.02 
 
 		 226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0761  methylation precursor  37.8 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  32.69 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  30.46 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  31.1 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  31.07 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  31.1 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  28.49 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  28.82 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  28.82 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  28.82 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  28.82 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  28.82 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  28.82 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  33.59 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  31.06 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  30.46 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  27.91 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  33.64 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  28.23 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  31.34 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  32.43 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  31.06 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  44.07 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  26.15 
 
 		 254 aa  52  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  26.42 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  27.07 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  31.79 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  31.79 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  41.38 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  28.57 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  27.66 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  27.14 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  28.65 
 
 		 253 aa  45.1  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  38.71 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  27.78 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  33.87 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  35.59 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  34.33 
 
 		 221 aa  42  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  27.78 
 
 		 201 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>