63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55530 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  100 
 
 		 213 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  85.26 
 
 		 191 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  48.28 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  40.78 
 
 		 204 aa  138  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  31.82 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  32 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  32 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  25.7 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  32 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  32 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  32 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  32 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  33.15 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  31.05 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  30.86 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  31.05 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  29.67 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  32.79 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  32.57 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  36.17 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  27.64 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  44.62 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  41.94 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  42.37 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  34.06 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  42.86 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  28.72 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  44.07 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  46.43 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  29.59 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  33.58 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  42.86 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  33.58 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  40.68 
 
 		 282 aa  49.3  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  38.81 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  27.57 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  40.98 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  26.53 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  33.73 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  31.65 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  38.71 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  34.25 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  23.12 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  27.81 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  30.38 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  26.34 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  35 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  31.62 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  35.82 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  37.7 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  31.63 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  33.87 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  22.61 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  26.58 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  26.32 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  26.81 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  26.81 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  34.33 
 
 		 216 aa  42  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  26.81 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  26.81 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  33.33 
 
 		 232 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 222 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>