47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3387 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  100 
 
 		 230 aa  460  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  62.21 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  45.08 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  44.22 
 
 		 247 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  45 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  34.91 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  31.37 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  32.16 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  30.88 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  30.88 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  30.88 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  30.88 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  30.88 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  30.88 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  29.19 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  29.94 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  29.19 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  28.71 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  28.37 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  28.92 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  28.93 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  27.78 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  32.43 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  31.97 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0015  putative general secretion pathway protein J  28.1 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0055  general secretion pathway protein  28.1 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163391  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  46.43 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  43.55 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  30.06 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  38.71 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  32.43 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  41.94 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  37.88 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  38.33 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  27.57 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  37.14 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  34.33 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  36.62 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  28.57 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  28.69 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  27.14 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  30.59 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  41.3 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  33.93 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  31.75 
 
 		 206 aa  42  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  39.13 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  39.13 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>