87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4245 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  100 
 
 		 197 aa  396  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  40 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  38.81 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  40.82 
 
 		 246 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  37.69 
 
 		 216 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  34.31 
 
 		 225 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  32.68 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  35 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  36 
 
 		 259 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  33.67 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  34.18 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  34.33 
 
 		 259 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  33.83 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  33.83 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  32.83 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  33.83 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  33.68 
 
 		 259 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  34.33 
 
 		 253 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 253 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  37.69 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  33.85 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 		 255 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  33.5 
 
 		 264 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  31.31 
 
 		 251 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  32.24 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  29.35 
 
 		 215 aa  95.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  30.73 
 
 		 201 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  30.73 
 
 		 199 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  30.73 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  33.5 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  30.21 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  29.03 
 
 		 189 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  28.8 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  30.37 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  30.05 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  29.56 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  27.59 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  30 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  26.04 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  30 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  25.52 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  30.52 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  31.82 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  30.43 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  32.09 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  27.59 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  26.5 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  29.7 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  27 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  27.14 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3310  Type II secretory pathway component PulJ-like protein  27.03 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.77 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  27.64 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  32.61 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  31.21 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  31.21 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  28.46 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  30.87 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  31.16 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  27.98 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  30.98 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0724  hypothetical protein  34.33 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521463  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  35.48 
 
 		 232 aa  45.1  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  28.08 
 
 		 223 aa  44.7  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  28.69 
 
 		 242 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  28.69 
 
 		 242 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  28.69 
 
 		 242 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  28.69 
 
 		 242 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  28.69 
 
 		 242 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  28.69 
 
 		 242 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  26.6 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  26.6 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  30 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  26.6 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.278127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  26.6 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  26.6 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  28.69 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  31.25 
 
 		 291 aa  42  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1035  hypothetical protein  32.81 
 
 		 237 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1316  prepilin-type cleavage/methylation-like  26.58 
 
 		 204 aa  42  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.680548  normal  0.0218329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  31.75 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1038  hypothetical protein  36.21 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711231  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3236  hypothetical protein  36.21 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723853  normal  0.49379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0986  hypothetical protein  36.21 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.810424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>