84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1528 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  100 
 
 
291 aa  588  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  23.75 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  22.68 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  36.96 
 
 
211 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  30.36 
 
 
237 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  28.57 
 
 
237 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  23.47 
 
 
241 aa  63.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  25.44 
 
 
236 aa  62.4  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  21.09 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  30.14 
 
 
219 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  43.33 
 
 
230 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  43.75 
 
 
216 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  23.69 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  26.78 
 
 
239 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  23.61 
 
 
253 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  27.85 
 
 
251 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  30.67 
 
 
240 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  40.58 
 
 
233 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3524  hypothetical protein  41.27 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0132086  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  42.42 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  40.62 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  30.34 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  39.68 
 
 
202 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  39.34 
 
 
225 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  42.42 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  40.62 
 
 
232 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  30.14 
 
 
240 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  39.71 
 
 
232 aa  53.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  29.17 
 
 
228 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  44.26 
 
 
212 aa  52.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  23.63 
 
 
204 aa  52.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  38.33 
 
 
227 aa  52.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  28.87 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  42.19 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  23.75 
 
 
242 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  23.75 
 
 
242 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  27.03 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  36.51 
 
 
199 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  27.97 
 
 
255 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  39.13 
 
 
250 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  23.75 
 
 
242 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  23.77 
 
 
205 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  30.54 
 
 
221 aa  49.7  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  27.97 
 
 
252 aa  49.7  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  28.37 
 
 
259 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  28.37 
 
 
263 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  28.37 
 
 
259 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1078  hypothetical protein  35.94 
 
 
227 aa  49.3  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  23.53 
 
 
242 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  23.53 
 
 
242 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  23.53 
 
 
242 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  23.65 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  23.32 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  40 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  35.82 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  38.71 
 
 
195 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  38.71 
 
 
195 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  32.2 
 
 
222 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  38.71 
 
 
195 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 
208 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  38.71 
 
 
195 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0537  methylation  35.09 
 
 
226 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  38.71 
 
 
195 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1324  methylation  37.5 
 
 
235 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  38.71 
 
 
223 aa  46.6  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  35.71 
 
 
231 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  32.2 
 
 
229 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  25.17 
 
 
234 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  25.17 
 
 
224 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  38.46 
 
 
199 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  37.7 
 
 
202 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  38.46 
 
 
199 aa  45.8  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  38.46 
 
 
201 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  37.74 
 
 
212 aa  45.8  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  23.11 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  38.46 
 
 
201 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  36.92 
 
 
225 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  34.43 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  29.58 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0922  Type II secretory pathway component  36.54 
 
 
217 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235402  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3131  general secretion pathway protein J  33.87 
 
 
215 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702697  normal  0.037121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
126 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0777  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  43.75 
 
 
185 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  32.63 
 
 
133 aa  42.7  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>