43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0777 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0777  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2687  pilus assembly protein Fim  54.39 
 
 		 174 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0716  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  32.76 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0709  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.43 
 
 		 190 aa  84.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0665  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  32.58 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.956301  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  28.49 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  26.88 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  27.33 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  27.71 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  24.12 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  25.62 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  36.23 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  27.61 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  26.42 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.69 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  38.1 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  27.27 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  38.1 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  22.92 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  25.44 
 
 		 171 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  28.57 
 
 		 162 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  33.77 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  33.78 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  30.4 
 
 		 233 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  33.77 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  28 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2665  methylation  25.29 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0676  hypothetical protein  33.8 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  27.4 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  32.5 
 
 		 166 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  34.78 
 
 		 188 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  32.95 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  34.57 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0856  pilus assembly protein  26.49 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  32.76 
 
 		 171 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  36.51 
 
 		 145 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  22.46 
 
 		 192 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  43.75 
 
 		 291 aa  41.6  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  34.72 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  28.74 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  37.27 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  37.84 
 
 		 168 aa  41.2  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  23.03 
 
 		 194 aa  41.2  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>