More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3425 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  97.92 
 
 		 144 aa  286  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  97.22 
 
 		 144 aa  285  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  84.72 
 
 		 144 aa  254  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  62.07 
 
 		 145 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  61.38 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  60.69 
 
 		 145 aa  183  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  52.94 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  32.35 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  32.14 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  40.59 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  48.53 
 
 		 166 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  31.78 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.77 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  36.49 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  54.1 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  43.48 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  39.05 
 
 		 200 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  47.83 
 
 		 194 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  45.9 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  47.06 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  26.04 
 
 		 182 aa  62  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  42.11 
 
 		 167 aa  60.1  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  42.62 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  50.82 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  36.11 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  40.54 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  32.09 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  52.24 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  40.79 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45.9 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  40.58 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.26 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  32.69 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  44.78 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  26.11 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  34.78 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  46.43 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  46.43 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  48.53 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  30.89 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  50.98 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  52 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3254  pilin, putative  32.26 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  42.86 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  56.41 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  31.51 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.77 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  35.53 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  29.55 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  62.5 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  52.5 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0400  N-terminal methylation site  27.74 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  52.5 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  32.03 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  46.15 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  32.03 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.82 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  52.38 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  40 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  35.16 
 
 		 208 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  35.53 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  37.68 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  40.3 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  42.11 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  34.43 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  51.35 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  48.78 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  50 
 
 		 163 aa  52  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  32.5 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  32.98 
 
 		 203 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  45.65 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  39.19 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  35.14 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  41.56 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  42.86 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  51.28 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  45.65 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  56.1 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  47.62 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  48.78 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  52.5 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  73.53 
 
 		 166 aa  50.8  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  54.29 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  50 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  37.68 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  47.37 
 
 		 171 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  29.61 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  28.36 
 
 		 184 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  42.19 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  47.62 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  53.66 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  63.33 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  63.33 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  45.24 
 
 		 168 aa  50.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  40.74 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  36.07 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  30.26 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  51.28 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>