More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0866 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  100 
 
 
194 aa  393  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  36.72 
 
 
182 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  41.58 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  38.24 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.86 
 
 
214 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.18 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.84 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40 
 
 
214 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  34.12 
 
 
174 aa  84.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  40.62 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  38.32 
 
 
171 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  31.76 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  35.2 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  30.06 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.95 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  40.74 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  43.96 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  32.29 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  32.35 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.79 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.53 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  33.98 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  32.73 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  33.61 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.77 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  37.31 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  30.48 
 
 
195 aa  64.3  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.49 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  42.22 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  31.51 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.22 
 
 
170 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.74 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  35.71 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  44.29 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  51.79 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.37 
 
 
170 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  32.19 
 
 
157 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  30.54 
 
 
192 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  50 
 
 
145 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.37 
 
 
170 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1707  putative type IV pilus assembly protein FimT  38.28 
 
 
170 aa  62  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  30.11 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  29.17 
 
 
163 aa  62  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  50 
 
 
145 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1769  fimbrial protein FimT  37.5 
 
 
170 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  39.22 
 
 
222 aa  61.6  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.48 
 
 
177 aa  61.6  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  30.69 
 
 
195 aa  61.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  26.46 
 
 
208 aa  61.2  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.74 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  29.94 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  31.52 
 
 
161 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  43.94 
 
 
168 aa  60.1  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  26.79 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  31.73 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  30.36 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  37.5 
 
 
191 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  28.4 
 
 
157 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  46.27 
 
 
144 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  46.27 
 
 
144 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  37.37 
 
 
186 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01320  pre-pilin like leader sequence  34.38 
 
 
157 aa  58.2  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  43.66 
 
 
179 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  30.91 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0489  methylation  30.06 
 
 
175 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  44.78 
 
 
144 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  30.91 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  39 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  36.36 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  34.88 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  33.67 
 
 
188 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  26.79 
 
 
170 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  26.79 
 
 
170 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  39 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  36.89 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  29.21 
 
 
178 aa  55.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  35.92 
 
 
184 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  26.37 
 
 
203 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.69 
 
 
164 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.69 
 
 
164 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.69 
 
 
164 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.69 
 
 
164 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  42.86 
 
 
144 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.14 
 
 
164 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.68 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  29.41 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.24 
 
 
151 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.95 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.42 
 
 
170 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  37.18 
 
 
111 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  26.79 
 
 
186 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1219  putative type IV pilus biogenesis protein  29.71 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  59.46 
 
 
174 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  52.94 
 
 
147 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  43.28 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2562  uridylate kinase  31.25 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.02 
 
 
178 aa  52.4  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.14 
 
 
173 aa  52  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.85 
 
 
170 aa  52  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.33 
 
 
195 aa  52  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>