129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0021 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  100 
 
 		 194 aa  393  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  35.12 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.58 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  36.09 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  33.53 
 
 		 206 aa  84.7  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  30.59 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.57 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  29.73 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  29.26 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  32.95 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  31.14 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.95 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.86 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  29.88 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  31.93 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.81 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  31.14 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  31.14 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  36.73 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.23 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  29.09 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28.49 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  41.41 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.62 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0489  methylation  25.52 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  28.65 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.09 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.9 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  52.24 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.65 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  29.59 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  36.84 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.82 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.58 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.71 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  30.49 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  32.09 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  29.52 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.61 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.71 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0856  pilus assembly protein  30.46 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.92 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  28.57 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  27.87 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  32.61 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0607  type IV pili biogenesis protein FimT, putative  28.32 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.9 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.77 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  31.14 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  28.99 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  28.24 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0653  type IV pili biogenesis protein FimT  28.83 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.679722  normal  0.506575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.11 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.67 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  28.08 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  30 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  29.32 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  30 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  30 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  32.12 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.4 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  31.01 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  27.96 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.39 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.98 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0648  hypothetical protein  27.17 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0857  general secretion pathway protein H  42.86 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  41.54 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01320  pre-pilin like leader sequence  35.16 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.46 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  40.58 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  26.52 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  41.54 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  27.61 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2665  methylation  29.33 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  40 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  38.71 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  27.41 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  40 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  40 
 
 		 145 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2562  uridylate kinase  27.85 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  40 
 
 		 145 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  34.94 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0562  putative fimT protein  27.74 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000705405  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  29.13 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  27.59 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  32.05 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.38 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  24.56 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  33.73 
 
 		 160 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1707  putative type IV pilus assembly protein FimT  30.1 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  25.82 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  27.84 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  36.47 
 
 		 175 aa  48.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2834  protein involved in methylation  29.05 
 
 		 171 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1769  fimbrial protein FimT  30.1 
 
 		 170 aa  47.8  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  31.17 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  30.19 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>