More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4674 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4674  methylation  100 
 
 
169 aa  337  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  63.01 
 
 
179 aa  205  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4781  Tfp pilus assembly protein  59.09 
 
 
159 aa  180  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  54.49 
 
 
160 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  56.21 
 
 
168 aa  149  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  49.13 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  44.02 
 
 
178 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  45.95 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  43.86 
 
 
138 aa  99  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  76.67 
 
 
136 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  40.36 
 
 
147 aa  95.5  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  38.2 
 
 
170 aa  92  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  41.46 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  41.01 
 
 
196 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  63.08 
 
 
160 aa  87.4  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  39.01 
 
 
179 aa  84  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  73.58 
 
 
166 aa  84  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  88.37 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  57.97 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  71.43 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  34.46 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  37.02 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  33.9 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  35.67 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  58.06 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  65.38 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  33.33 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  56.67 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  66 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  36.42 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  35 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  59.32 
 
 
179 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  54.84 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  62.5 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  61.82 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  42.86 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  51.47 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  53.12 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  44 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  60 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  38.79 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  54.1 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  73.81 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  49.15 
 
 
199 aa  67.8  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  53.85 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  51.61 
 
 
198 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  57.41 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  75 
 
 
111 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  40.85 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  49.25 
 
 
207 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  54.39 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  54.39 
 
 
198 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  54.39 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  50.79 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  49.25 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  45.57 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  76.32 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  34.27 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  45.57 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  69.05 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  48.53 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  30.99 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  45.61 
 
 
446 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  45.61 
 
 
438 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  58.33 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  69.23 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  75.61 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  50.85 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  51.28 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  88.24 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  33.12 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  60.78 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04886  pilin  37.87 
 
 
141 aa  62.4  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.969324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  88.24 
 
 
138 aa  62.4  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0370  prepilin-type cleavage/methylation  48.6 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000439379  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  38.52 
 
 
171 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  55.77 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.81 
 
 
172 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  61.9 
 
 
152 aa  61.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  82.86 
 
 
143 aa  61.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  64.29 
 
 
133 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  40.96 
 
 
205 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  60.47 
 
 
207 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  49.12 
 
 
176 aa  60.8  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  34.52 
 
 
146 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  34.52 
 
 
146 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  56 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  61.9 
 
 
133 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  34.52 
 
 
146 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  34.52 
 
 
146 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  34.52 
 
 
146 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  34.52 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  34.52 
 
 
146 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.15 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  44.78 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0278  type IV pilin, putative  64.86 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  64.86 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  48 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  64.86 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  36.79 
 
 
151 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>