242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1378 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  100 
 
 		 171 aa  342  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01320  pre-pilin like leader sequence  52.56 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1769  fimbrial protein FimT  45.4 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1707  putative type IV pilus assembly protein FimT  45.4 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  37.71 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.07 
 
 		 187 aa  84.3  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  40.62 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  29.34 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  30.67 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  32.14 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  35.2 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.86 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  38.46 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  28.49 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  39.42 
 
 		 206 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  33.53 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  31.09 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  34.94 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  41.41 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  29.85 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  28.09 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  47.76 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  33.33 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  34.51 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  36.8 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  33.96 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  29.1 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  45.21 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  38.82 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.07 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  38.58 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  29.05 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  27.27 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0857  general secretion pathway protein H  34.16 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.99 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  32.75 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  41.89 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  41.89 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  40.54 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  46.03 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  47.62 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.81 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  46.03 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  27.81 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  34.35 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  25.62 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  28.06 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  41.79 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  36.05 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.31 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.12 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.79 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.19 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0853  methylation site containing protein  32.35 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3169  methylation site containing protein  32.35 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.88 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  33.73 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  32.04 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.75 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.05 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.67 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  30.52 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  38.89 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2834  protein involved in methylation  33.71 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.33 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  53.19 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.83 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  29.88 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0562  putative fimT protein  43.86 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000705405  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  38.55 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  36.76 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2665  methylation  29.2 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.97 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  31.85 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1621  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  43.64 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000506995  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.57 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  43.86 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.55 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  30.23 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  29.89 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.65 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.33 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.27 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.48 
 
 		 177 aa  51.2  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  39.44 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  37.5 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  26.59 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  37.5 
 
 		 144 aa  50.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  26.59 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  26.22 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  47.17 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0963  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.08 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  59.46 
 
 		 132 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.68 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  45.83 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  27.67 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  39.81 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  32.32 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>